بالنسبة للموضوع المخابرات السودانية في ذلك الوقت كانت قوة كبيرة و لديها اجهزة مساندة تتبع للحركة الاسلامية الجهة الحاكمة في السودان و في الغالب هي التي تتواصل مع هذه التنظيمات و الجماعات.
في بداية التسعينات كان السودان يعاني من حرب اهلية منذ الخمسينات و دخل في تحالفات غريبة مع جهات تسببت في ازمات و عقوبات دولية و عزلة طويلة.
بالمناسبة الحركة الاسلامية التي حكمت السودان ليست جزء من تنظيم الاخوان المسلمين لكن كانت تمثل اكبر كيان للاسلاميين في السودان بينما الاخوان المسلمين في السودان لديهم مجموعة منفصلة تتبع للتنظيم الدولي.
العلاقات مع مصر كانت متقلبة بطريقة غريبة فترات يكون الوضع جيد و فجأة عملية مشابهة من احد الطرفين تخرب العلاقات و تعمل قطيعة لعدة اشهر