ما تزال إدارة العمليات العسكرية تحتفظ في سجون عدرا وسجن حماة المركزي وسجن حارم، نحو 9 آلاف عنصر وضابط من قوات النظام بينهم نحو 2000 ممن فروا إلى العراق بعد انهيار النظام في 8 كانون الأول الماضي حيث كانوا ينتشرون في نقاط ضمن بادية حمص ودير الزور والحسكة، وتمت إعادتهم لاحقاً بالتنسيق بين الحكومة العراقية وإدارة العمليات العسكرية السورية، والبقية تم اعتقالهم على حواجز أو خلال مداهمات قامت بها إدارة العمليات العسكرية.
وبالمقابل، أجرت إدارة العمليات العسكرية التسوية لآلاف العناصر، الذين التزموا منازلهم وسلموا أسلحتهم، كما شنت حملات اعتقال في المحافظات السورية لاسيما حمص والساحل السوري، وحماة وريف دمشق.
كما اعتقلت المئات من عناصر النظام السابق والتشكيلات العسكرية والأمنية والمدنيين المتعاونين مهم، وبلغ العسكرية في مدينة حمص وريفها الشرقي نحو 1450 شخص.
